#днк
Под давлением обстоятельств стала администратором регионального днк-проекта на сайте gedmatch.com по Тюменско-Омскому региону.
Гедмэтч в нашей жизни много хорошего сделал, теперь вот русскоязычное днк-сообщество освоило инструменты массового сравнения днк-тестов. Вариант с региональной группой, как оказалось, самый удобный и визуально понятный.
Все просто: сдаете тест, загружаетесь на гедмэтч, ищете свой региональный проект и подключаетесь.
Сейчас каждый день открываются новые региональные (и даже более локальные группы), поэтому оставлю тут пост со списком регионов, вдруг сможете найти свой.
А мне теперь главное не забывать каждый день принимать новых участников!
‼️Nature, 2026
🗣️🗣️В 2х словах:
Все и Вы, тоже выдыхаете ДНК, которая сохраняется около 1 суток в том месте, где Вы были.
🐅Наверное, именно так происходит идентификация животных друг другом
❌В общем, перспективы здесь открываются интересные, но в каких-то аспектах и весьма пугающие.
Возможности детектирования и анализа макромолекул ДНК в воздухе.
Они туда могут попадать, например, внутри мелких капель воды, которые выделяются при дыхании живых организмов, или при переносе ветром пыли биогенной природы.
В результате, как пишут авторы статьи, в воздухе во взвешенном состоянии находится много цепочек ДНК, которые можно выделить, секвенировать и использовать полученную информацию для анализа состояния экосистемы:
В статье много интересных фактов.
Например, рассказано о детектировании ДНК тигра вблизи одного из английских зоопарков на расстоянии 200 метров от вольера.
Или о новой технологии, которая позволяет обнаруживать известные патогены сельскохозяйственных культур за несколько недель до того, как они причинят видимый ущерб.
Но наибольший публичный интерес должна вызвать возможность идентификации личности по ДНК, которую человек выделяет при дыхании.
Вот как об этом написано в статье:
Идея непрерывного сбора ДНК из воздуха в общественных местах беспокоит некоторых ученых. Выдохните во время вечерней прогулки, и ваша ДНК может попасть в незаметно установленный городской пробоотборник.
Секвенирование, использующее быстро развивающиеся, дешевые и портативные методы, может помочь идентифицировать отдельных лиц практически в режиме реального времени. Но если дыхание выбрасывает вашу ДНК в воздух, как это соотносится с нашим пониманием конфиденциальности?
Тем не менее ряд ученых уже начали изучать потенциал ДНК, содержащейся в воздухе офисов и кондиционеров, на предмет ее использования в качестве криминалистического инструмента.
Они говорят, что ДНК людей, недавно находившихся в здании, можно обнаружить в воздухе в течение суток.
Для более долговременной записи можно использовать ДНК, осевшую из воздуха на поверхности.
#ДНК
🔍Возможные причины выявления ДНК свинины в продукции
В последнее время наблюдается тенденция выявления ДНК свинины в халяльных продуктах. Такие проверки могут приводить к общественному недопониманию информации. Мы составили краткий обзор вероятных причин, по которым обнаруживается ДНК свинины.
🖐Человеческий фактор
Грубо говоря, сотрудник съел на обед бутерброд со свининой, забыл помыть руки и вышел на линию. Произошла контаминация – макромолекулы при соприкосновении с оборудованием попали в будущую колбасу, в которой потом лабораторно обнаружат эту ДНК.
🔬Нарушение методики проведения исследования халяльной продукции
Не каждая лаборатория знакома с методикой проведения лабораторных исследований халяль-образцов. Исследование халяль-продукции требует соблюдение специальных условий – отдельные ножи, доски, оборудование и прочие инструменты, не соприкасающиеся с харамом.
🚛Несоблюдение товарного соседства и логистики
В торговых сетях необходимо отделять халяль-продукцию от нехаляль. К логистике применяются те же требования.
Дополнительные проблемы:
🗒Отсутствие ГОСТов на отбор образцов и проведение исследования халяль-продукции
Появление такого ГОСТа позволит регламентировать процесс отбора образцов и лабораторного исследования халяльной продукции, что приведет к минимизации инцидентов с обнаружением ДНК свинины.
🧬Выявляется наличие ДНК (макромолекулы), а не (количество) масса свинины в продукте
В настоящее время нормативная база не подразумевает четких разграничений между следовыми значениями и действительно присутствием того или иного вида сырья в продукте. Дело в том, что для анализа видового состава продукции используется качественный (результат «да – нет» или «нашли – не нашли»), а не количественный метод (если нашли, то сколько?), чувствительность которого крайне высока: практически двух молекул достаточно чтобы определить наличие постороннего ДНК.
#днк
Этнокарты ДНК. Обновление на MyHeritage. Ч.2
Подытожу
Ранее я уже писал, что не стоит рассматривать этнокарты от разных ДНК-компаний как истину последней инстанции и относится к ним надо весьма критически, скорее как направление для поиска и не более того. Эти слова я готов повторить и сейчас, причём ещё с большей уверенностью. И поводом для этого стали исчезнувшие из маминого теста финны. До сегодняшнего дня я полагал, что несмотря на всю нестабильность этнокарт (поэтому у меня нет глобальных претензий к пересмотренным МХ результатам) в них всё же есть и столбы в виде хорошо протестированных народов, таких как финны или евреи. Однако случай с МХ показал, что и здесь результат может пересматриваться, причём весьма радикально, вступая между собой в противоречие.
#ДНК
Этнокарты ДНК. Обновление на MyHeritage. Ч.1
Давно не писал о ДНК и вот недавно MyHeritage (МХ) дал повод вернуться к этой теме.
На днях МХ начал обновление этнокарт. Процесс этот не быстрый и большая часть тестов только ожидают обновления, впрочем есть и те, которые их уже получили. В моём случае обновления получили два главных для меня теста - мой и моей мамы. И знаете, я нахожусь в замешательстве.
Для начала продемонстрирую результаты своего теста, где левый столбец показывает данные до обновления, а правый - что мы имеем после.
Финн 54,7% - 60,6%
Прибалт 32,6% - 23,7%
Балканец 11,8% - 0%
Выходец из Северной или Западной Европы 0,9% - 0%
Восточноевропеец 0% - 15,7%
Из этих данных мы видим, что МХ повысил мне долю финнов на 5,9%, скорее всего взяв её из прибалтов, которых стало меньше на 8,9%. Такой процент финнов считаю адекватным, так как ранее я уже рассказывал, что финны есть и в мамином тесте, а после и вовсе я нашёл в её древе несколько семей ижор (и это только официально доказанные). Что касается прибалтов, то помимо ассоциативно представляемых жителей Литвы, Латвии и Эстонии, могут подразумеваться и жители Северо-Запада России.
Далее интереснее. Из результатов полностью исчезли две группы - балканцы и северные или западные европейцы с суммарным результатом 12,7%, зато им на смену пришла новая группа - Восточноевропеец, которая по всей видимости взяла на себя объединённые проценты двух исчезнувших групп, а также остатки от прибалтов, которые не перешли финнам. Столь радикальный пересмотр результатов связываю с резко возросшим количеством тестируемых из Восточной Европы (речь конечно в первую очередь о гражданах Украины, проживающих в данный момент в Европе, хотя конечно же некий процент граждан России и Беларуси в итоговой выборке тоже безусловно присутствует).
Процент восточноевропейцев в моём случае считаю заниженным. Полагаю, что доминирующая финская ДНК «перетянула» часть восточноевропейских процентов прибалтам, которых, не смотря на снижение, всё равно остаётся много.
Ну а теперь поговорим про тест моей мамы.
Прибалтка 59,2% - 54,2%
Балканка 35,2% - 0%
Финка 5,6% - 0%
Восточноевропейка 0% - 45,8%
Первое, что бросается в глаза, так это то, что МХ полностью убрал финских сегмент. На фоне выросшего у меня на 5,9% финского ДНК полное исчезновение маминого вызывает некое недоумение, ведь по идее её финский сегмент должен был также возрасти (ну или остаться неизменным). Причём свои проценты потеряли и прибалты, которые по идее и должны были получить «финнов».
Помимо финнов из результатов исчезли и балканцы. Однако, в отличии от финнов, исчезновение балканцев сюрпризом не стало, они ожидаемо легли в основу восточноевропейцев, которых у мамы изначально не было, а теперь 45,8%.
Если учесть тот факт, что в мамином результате теперь официально появились восточноевропейцы, то вызывает интерес столь высокий процент прибалтов. Впрочем, у меня есть как минимум три неисследованные ветки на уровне прапра:
- Внебрачный отец моей прабабушки Татьяны Лаперировой, о котором неизвестно ничего, кроме семейного придания о том, что он был немец по национальности, жил в Петербурге, имел звание генерала и был помощником коменданта города.
⁃ Мать моего прадеда Иосифа Брезанского. Как и об отце Татьяны, о нём есть тоже только семейное придание (даже источник один и тот же). Там говорится, что мать Иосифа была знатного происхождения (скорее всего речь идёт о белорусской шляхте), но их семья обеднела и она вышла замуж за крестьянина.
⁃ Ещё одна моя прабабушка, мать Сергея Шломина. Согласно автобиографиям двух её сыновей родом она из местечка Мельник (ныне восточная Польша).
И это только прапра, а ведь есть и другие пробелы в семейной истории.
#ДНК
🇷🇺Сегодня выходит в эфир выпуск передачи «ДНК» с моим участием.
Тема сложная: после смерти мужчины многодетная мать пытается оформить пенсию по потере кормильца, а сестра мужа не признает детей. В студии было очень жарко! Посмотрите этот выпуск.
📺«ДНК» 17:50 на НТВ.
Буду ждать вашу обратную связь после эфира. Обсудим!😏
📹: НТВ
💎Подпишись на Маргариту Гаврилову | САЙТ | MAX | VKONTAKTE | RUTUBE| YOUTUBE | TIKTOK | INSTAGRAM*
(*Запрещенная соцсеть в РФ)
🧑⚖️Если Вам нужна моя юридическая помощь, звоните: +7 (916) 302‑08‑38
#ДНК
🇷🇺Делюсь с вами темой программы ДНК!
Сколько же на белом свете «чудес» и «чудесатых людей»? Посмотрите сами!
Она была замужем, родила ребёнка, муж сидел и не знал👀. Всем сказала, что это её племянник🤦♀️.
Прелесть история, одним словом!
📹: НТВ
💎Подпишись на Маргариту Гаврилову | САЙТ | VKONTAKTE | YOUTUBE | TIKTOK | INSTAGRAM*
(*Запрещенная соцсеть в РФ)
🧑⚖️Если Вам нужна моя юридическая помощь, звоните: +7 (916) 302‑08‑38
#ДНК
Давненько я что-то ничего не писал. Ну и сегодня не буду))
А вот в ближайшее время планирую пару интересных постов из рубрики «Век живи - век учись». Ну а чтобы ожидание не было утомительным, хочу поделиться с вами ссылкой на выступление Олега Балановского, где он рассказывает о генетике народов и мифах, связанных с ней. Приятного просмотра!
#ДНК
https://youtu.be/XBUWM9jPPT8?si=aE2vZKsysL2LzaRy
У меня тут появился новый повод порассуждать на тему этнокарт аутосомных ДНК-тестов и точности их интерпретаций. Если быть более точным, то речь пойдёт о результатах компаний Генотек и MyHeritage. Два года назад я делал тест в компании FTDNA и позднее залил полученные данные на Генотек и MH. Уже в этом году я сдавал полногеномный тест в компании Nebula, из которого с помощью https://wgsextract.github.io/ удалось извлечь аутосомную ДНК и теперь есть возможность сравнить мои результаты.
В начале я буду указывать популяцию, потом проценты теста #1 (ФТДНА) и через дефис проценты теста #2 ( Небула).
Приступим.
MyHeritage:
Финн 54,7%-54,8%
Прибалт 32,6%-32,7%
Балканец 11,8%-11,7%
Выходец из Северной или Западной Европы 0,9%-0,8%
Генотек:
Финны 49%-49%
Русские 49%-49%
Карелы и вепсы 2%-2%
В целом, на первый взгляд, результаты соответствуют друг другу. Разве что в тесте MH к финнам и прибалтам добавилось по 0,01%, а у балканцев и европейцев на 0,01% стало соответственно меньше. Ну а Генотек и вовсе показал 100% одинаковые результаты, но только на данном этапе. Как известно, Генотек дает не только процентраж по популяциям, но и берет на себя смелость сравнить ваши результаты с результатами коренных жителей разных регионов России (и не только). Вот тут и пошёл рассинхрон, который вы можете посмотреть ниже на скинах. В прочем, к данной функции Генотека вопросы были давно и остаются до сих пор. Особенно забавно было, когда тест говорил, что у тестируемых есть больше совпадение с жителями Калининградской области. После ряда жалоб Калининградскую область из выборки убрали.
В целом, ничего шокирующего сравнение не показано. Результаты +/- те же.
Ну а для тех, кто плотно интересуется ДНК-генеалогией и планирует делать WGS в YSEQ, я прикрепляю ссылку на инструкцию о выгрузке данных. https://docs.google.com/file/d/1sluHIHI7MVuErmrZ2fCg10sORbSiBynw/edit?usp=docslist_api&filetype=msword
Сразу оговорюсь, автор инструмента не я, а мой приятель, за что ему больше спасибо!
#ДНК
Помимо подробных данных по Y-хромосоме, благодаря полногеномному ДНК тесту, мне удалось также узнать гаплогруппу своей митохондринальной ДНК - T1a1ay. Я уже рассказал, что в отличие от Y-ДНК, митохондриальная передается по прямой женской линии. То есть, вам она досталась от матери, ей от её матери и так по цепочке в глубину веков. В моём случае - это Авдотья Михайловна, родившаяся около 1742 года и проживавшая после замужества в Красном Селе. Что касается самой гаплогруппы, то на данный момент мне удалось узнать, что она имеет довольно большой ареал расселения (ССЫЛКА). На этом всё. Своим мнением о пользе митохондринальной ДНК в практической генеалогии я уже рассказал - её нет. Но если вдруг кто-то убежден в обратном, буду рад ознакомиться с вашим мнением в комментариях.
#ДНК
Продолжение раздумий над ДНК результатами.
В прошлый раз я остановился на том, что помимо результатов троюродного брата моего отца (В), у меня есть результаты моих двоюродной (Е) и троюродной (А) сестёр, которые также не вносят ясности. Так общее ДНК двоюродной сестры со мной составляет 693,3 сМ, а с нашим троюродным дядей 95,8 сМ. При этом средний показатель для данной степени родства со мной составляет 866 (интервал 396 - 1397) сМ. Что касается троюродного дяди, то для него средний показатель как и в случае со мной составляет 122 (14 - 353) сМ.
Совпадение (Е) с нашим троюродным дядей хоть и более близкое к среднему, нежели моё, но всё ещё меньше. Как в прочем и моё совпадение с ней - меньше среднего. При этом, помимо того, что мы с (Е) двоюродные брат и сестра (наши отцы братья), и у меня, и у (В) есть родственная связь с её матерью (И) и следовательно общее ДНК.
Что касается моей троюродной сестры (А), то с ней общее ДНК составляет 252,8 сМ при среднем 229 (41 - 592) сМ, что соответствует среднему значению. Общее ДНК между (А) и (В) также соответствует среднему - 138,6 сМ, при упомянутом ранее усредненном показателе 122 (14 - 353) сМ. Общее ДНК между (А) и (Е) также соответствует среднему показателю 245,2 сМ. При этом с матерью (Е) - (И), у (А) также есть пересечения. И если у меня совпадение с (И) составляет 43 сМ, то у (А) 79,9 сМ, хотя степень родства у нас с ней одинаковая. Тут кстати стоит отметить, что мои результаты для данной степени родства занижены в почти два раза. Готов предположить, что связанно это с тем, что мне в меньшей степени досталось ДНК по ветке Хуопалайнен, являющейся для меня, (А) и (И) общим предком.
Очень старался сделать этот пост максимально понятным, но что-то мне подсказывает, что у меня не получилось)))
Визуализация древа между мной, (Е), (А), (В) и (И) тоже ясности не внесёт. Есть конечно надежда на то, что результаты теста нашей четвероюродной тёти немного прояснят ситуацию, но с таким количеством родственных пересечений между предками шансы на это не велики.
UPD: итоговые выводы я сделаю, когда получу результаты ДНК четвероюродной тёти. На данный момент склоняюсь к тому, что (В) всё же является полнокровным троюродным дядей, с которым мы получили меньше общего ДНК, нежели это в среднем происходит.
#ДНК
Вернёмся к ДНК - генеалогии. Как я писал ранее, в аутосомных тестах родство определяется с помощью сантиморган (сМ). То есть, когда вы получаете результаты вашего теста, то благодаря информации об общих сМ вы можете выстроить предполагаемую степень родства. Если же степень родства вам известна, то вы можете подтвердить или же опровергнуть это родство. Последнее тоже иногда случается)) Я уже как-то рассказывал о том, что по результатам теста единокровный брат моего деда оказался ему не братом. Данная новость хоть и удивила меня, но разгадка всё же лежал на поверхности, так как совпадения по ДНК отсутствовало полностью. Куда сложнее дело обстоит в том случае, когда совпадение есть, но при этом количество СМ сильно занижено. Ну а чтобы было понятнее, приведу пример с троюродным братом моего отца (линия Пумалайнен), чьи результаты вызывают у меня вопросы. Итак:
Моё совпадение с троюродным дядей (Виктор) составляет 57,6 сМ, в то время как среднее значение для данной степени родства составляет 122 сМ, а допустимый интервал, согласно опубликованной ранее мною таблице, 14-353 сМ. Другими словами, моё совпадение с Виктором в два раза меньше среднего, но всё ещё в рамках минимального значения. Если снова обратиться к таблице, то можно увидеть, что моё совпадение с Виктором находится в рамках среднего с единокровным / единоутробным троюродным дядей - 66 (0-190) сМ. Тут, конечно, можно предположить, что преступление раскрыто, но не всё так просто. С одной стороны, цепочка совпадения Виктора до общего предка проходит по женской линии (мать и бабушка), в то время как у меня это прямая мужская линия (отец, дед, прадед). Следовательно, возможность адюльтера по линии Виктора практически равна нулю, в то время как у меня адюльтер возможен на уровне каждого поколения. С другой стороны, у меня есть результаты теста на Y-хромосому, мои и ещё одного Пумалайнена. Наш общий предок родился в конце 17 века. Что, в свою очередь, подтверждает моё происхождение по линии Пумалайнен. Вот интересная картина.
Также у меня есть результаты аутосомных тестов моих двоюродной и троюродной сестер по линии Пумалайнен, которые должны были бы прояснить картину. По факту же с ними тоже всё не так просто. Об их результатах, а также о сравнении их результатов с моим и дяди Вити я расскажу в следующий раз.
#ДНК