@pptdaily · Post #5 · 18.01.2019 г., 08:56
vcftools基于的是使用bgzip压缩过的vcf.gz文件,还需要用tabix进行index。将多个vcf样本进行merge使用vcf-merge命令,将同一样本的不同vcf整合使用vcf-concat #vcf#vcftools#snp
TGINSIGHT SIMILAR POSTS
Изходен канал @clockstackwheels · Post #482 · 2.08
Я участвую в конкурсе разработчиков «Код Петербурга», проводимом совместно VK и городом. По условиям нужно сделать или VK-приложение или чат-бота для VK/Маруси с какой-то важной для жителя или гостя города функцией, и с использованием одного из предоставленных внешних API. Я попробовал воплотить свои давние мысли по семантическому поиску по текстам, в чем мне помог @wooferclaw. Что-то подобное мы пытались соорудить на хакатоне в Салехарде, но сейчас я пошёл дальше. Бот для Маруси, который ищет мероприятия в Петербурге с сайта KudaGo. При этом к боту подключён морфологический словарь и тезаурус, который умеет определять домены и ассоциативные связи между словами. Работает вроде неплохо. Во-первых, довольно точно ищет по прямым связям. Например, хорошо понимает, что слова «научный» и «наука» одинаковые, хотя в словаре словоформ они разные. Во-вторых, умеет находить связи по области: допустим, если попросить что-то про пришельцев, предлагает экспозицию о внеземных цивилизациях, хотя ни в описании, ни в ключевых словах этой экспозиции нет слова «пришелец» однокоренных с ним. Но этот поиск приводит и к забавным последствиям, которые лично я не считаю недостатком, а скорее щепоткой соли в работе алгоритма. Так, при запросе о пришельцах может выдать выставку о коммунальных квартирах (что действительно близко по смыслу, но человеку, который ищет пришельцев, скорее всего нужно не это). А ещё на слово «крокодилы» предлагает экскурсию по рекам и каналам, мне очень нравится :) Потестить можно, открыв Марусю (в приложении ВК или в отдельном) и сказав «Запусти навык Куда Пойти в Петербурге». А результаты конкурса будут в октябре. Там ещё второй этап, на него тоже что-нибудь подам. #dev
Hashtags
Търсене: #vcftools
@pptdaily · Post #5 · 18.01.2019 г., 08:56
vcftools基于的是使用bgzip压缩过的vcf.gz文件,还需要用tabix进行index。将多个vcf样本进行merge使用vcf-merge命令,将同一样本的不同vcf整合使用vcf-concat #vcf#vcftools#snp