Что делать если нужно поставить какую-то Python-библиотеку а root-прав нет? То есть в систему библиотеку никак и ничего не поставить.
Есть как минимум два способа это решить правильно!
🔸 Сделать виртуальное окружение и ставить там что угодно.
Это позволит создать полностью независимое исполняемое окружение для ваших приложений.
Все библиотеки будут храниться в домашней директории юзера а значит доступ на запись имеется.
Создать очень просто:
python3 -m venv ~/venvs/myenvname
Теперь активируем окружение
# Linux
source ~/venvs/myenvname/bin/activate
# Windows
%userprofile%\venvs\myenvname\Scripts\activate.bat
Можно ставить любые библиотеки и запускать приложение.
Это стандартный метод работы с любым проектом. Если еще не используете его, то пора начинать. Даже при наличии root доступа!
🔸 Бывает, что нет возможности запустить приложение из своего виртуального окружения. Например, его запускает какой-то сервис от вашего юзера и вставить активацию окружения вы не можете.
В этом случае можно установить библиотеки для Python не глобально в систему, а только для юзера.
Выполните этот код в консоли:
python3 -m site
Вы получите что-то такое:
sys.path = [
'/home/user',
'/usr/lib/python37.zip',
'/usr/lib/python3.7',
'/usr/lib/python3.7/lib-dynload',
'/home/user/.local/lib/python3.7/site-packages',
...
]
USER_BASE: '/home/user/.local'
USER_SITE: '/home/user/.local/lib/python3.7/site-packages'
ENABLE_USER_SITE: True
Нас интересует параметр USER_SITE. Это путь к пользовательским библиотекам, которые доступны по умолчанию, если они есть.
Именно сюда будут устанавливаться модули если добавить флаг --user при установке чего-либо через pip
pip install --user requests
Для этой команды не нужны root-права.
После неё можно запускать системный интерпретатор без виртуальных окружений и установленная библиотека будет доступна для текущего юзера.
Параметр USER_BASE показывает корневую директорию для хранения user-библиотек. Её можно изменить с помощью переменной окружения PYTHONUSERBASE
export PYTHONUSERBASE=~/pylibs
python3 -m site
...
USER_BASE: '/home/user/pylibs'
USER_SITE: '/home/user/pylibs/lib/python3.7/site-packages'
Получается некоторое подобие виртуального окружения для бедных 😁 которое можно менять через эту переменную (не делайте так!Лучше venv!)
🔸 Дописывание пути в PYTHONPATH
Этот способ не входит в список "двух правильных", но тоже рабочий. Здесь придётся сделать всё несколько сложней.
Сначала ставим библиотеку в любое место указывая путь установки
pip3 install -t ~/mylibs modulename
Библиотека установится без привязки к какому-либо интерпретатору. То есть по умолчанию не будет видна. Теперь в нужный момент добавляем этот путь в sys.path или в PYTHONPATH.
Не буду советовать так делать. Единственный раз когда этот способ мне пригодился и решил поставленную задачу, это при создании общей библиотеки для кластера компьютеров.
Модули лежат в сети и подгружаются для всех из одного и того же места. То есть обновлять файлы требуется только один раз а не на всех хосты отдельно.
Минусы такого подхода:
▫️Нужно всем хостам пробить нужный путь в .bashrc или ещё куда-то чтобы он сетапился на старте.
▫️Чем больше хостов тем больше нагрузка на сеть. Иногда такой способ не подходит именно по этой причине. Тогда Ansible вам в помощь.
▫️Не очень подходит если хосты с разными операционками. Некоторые библиотеки различаются для Linux и Windows (там, где есть бинарники) и приходится мудрить более сложные схемы.
#tricks#basic
🔬BRCA1/2 у мужчин: новые данные, способные привести к изменениям клинической практики?🔬
⚡️Свежий обзор в JAMA Oncology подчеркивает необходимость пересмотра подходов к скринингу и лечению мужчин с мутациями BRCA1/2.
ℹ️Эти мутации традиционно ассоциируются с такими диагнозами как рак молочной железы и яичников у женщин, НО данные подтверждают их значимость и для мужского населения.
Ключевые выводы:
• Рак предстательной железы: носители мутации BRCA2 имеют повышенный риск развития рака предстательной железы в 4,7–8,6 раза по сравнению с общей популяцией. Абсолютный пожизненный риск достигает 60%. Для BRCA1 риск вырастает до 3,8 раза, с пожизненным риском в 15-45%.
• Рак молочной железы: Хотя это заболевание редко встречается у мужчин, у носителей BRCA2 риск возрастает до 7% (в сравнении с менее 1% в общей популяции). Риск для BRCA1 также повышен, но менее выражен.
• Рак поджелудочной железы: Мутации BRCA2 увеличивают риск развития рака поджелудочной железы в 3,5 раза. Носители BRCA1 также подвержены повышенному риску, но в меньшей степени.
Клинические рекомендации:
• Генетическое тестирование: Мужчины, особенно с отягощенным анамнезом по РМЖ, яичников или поджелудочной железы, должны рассматриваться для генетического тестирования. Э
• Скрининг: Исследование IMPACT подтверждает, что ежегодный скрининг PSA у мужчин с BRCA2 позволяет выявлять рак предстательной железы на более ранних стадиях, что значительно улучшает прогноз. Рекомендовано начинать скрининг с 40-45 лет.
• Терапия: Ингибиторы PARP показывают многообещающие результаты в лечении BRCA-ассоциированных раков у мужчин. Однако следует помнить о необходимости индивидуализированного подхода, особенно в отношении комбинированной терапии.
Ну а чтобы ответить на вопрос о необходимости внесения изменений в клиническую практику переходите👉 по ссылке👈и ждем Ваше мнение в комментариях 👇
#онкология#BRCA#мужскоездоровье#генетика#скрининг#JAMAOncology#МОО