Что делать если нужно поставить какую-то Python-библиотеку а root-прав нет? То есть в систему библиотеку никак и ничего не поставить.
Есть как минимум два способа это решить правильно!
🔸 Сделать виртуальное окружение и ставить там что угодно.
Это позволит создать полностью независимое исполняемое окружение для ваших приложений.
Все библиотеки будут храниться в домашней директории юзера а значит доступ на запись имеется.
Создать очень просто:
python3 -m venv ~/venvs/myenvname
Теперь активируем окружение
# Linux
source ~/venvs/myenvname/bin/activate
# Windows
%userprofile%\venvs\myenvname\Scripts\activate.bat
Можно ставить любые библиотеки и запускать приложение.
Это стандартный метод работы с любым проектом. Если еще не используете его, то пора начинать. Даже при наличии root доступа!
🔸 Бывает, что нет возможности запустить приложение из своего виртуального окружения. Например, его запускает какой-то сервис от вашего юзера и вставить активацию окружения вы не можете.
В этом случае можно установить библиотеки для Python не глобально в систему, а только для юзера.
Выполните этот код в консоли:
python3 -m site
Вы получите что-то такое:
sys.path = [
'/home/user',
'/usr/lib/python37.zip',
'/usr/lib/python3.7',
'/usr/lib/python3.7/lib-dynload',
'/home/user/.local/lib/python3.7/site-packages',
...
]
USER_BASE: '/home/user/.local'
USER_SITE: '/home/user/.local/lib/python3.7/site-packages'
ENABLE_USER_SITE: True
Нас интересует параметр USER_SITE. Это путь к пользовательским библиотекам, которые доступны по умолчанию, если они есть.
Именно сюда будут устанавливаться модули если добавить флаг --user при установке чего-либо через pip
pip install --user requests
Для этой команды не нужны root-права.
После неё можно запускать системный интерпретатор без виртуальных окружений и установленная библиотека будет доступна для текущего юзера.
Параметр USER_BASE показывает корневую директорию для хранения user-библиотек. Её можно изменить с помощью переменной окружения PYTHONUSERBASE
export PYTHONUSERBASE=~/pylibs
python3 -m site
...
USER_BASE: '/home/user/pylibs'
USER_SITE: '/home/user/pylibs/lib/python3.7/site-packages'
Получается некоторое подобие виртуального окружения для бедных 😁 которое можно менять через эту переменную (не делайте так!Лучше venv!)
🔸 Дописывание пути в PYTHONPATH
Этот способ не входит в список "двух правильных", но тоже рабочий. Здесь придётся сделать всё несколько сложней.
Сначала ставим библиотеку в любое место указывая путь установки
pip3 install -t ~/mylibs modulename
Библиотека установится без привязки к какому-либо интерпретатору. То есть по умолчанию не будет видна. Теперь в нужный момент добавляем этот путь в sys.path или в PYTHONPATH.
Не буду советовать так делать. Единственный раз когда этот способ мне пригодился и решил поставленную задачу, это при создании общей библиотеки для кластера компьютеров.
Модули лежат в сети и подгружаются для всех из одного и того же места. То есть обновлять файлы требуется только один раз а не на всех хосты отдельно.
Минусы такого подхода:
▫️Нужно всем хостам пробить нужный путь в .bashrc или ещё куда-то чтобы он сетапился на старте.
▫️Чем больше хостов тем больше нагрузка на сеть. Иногда такой способ не подходит именно по этой причине. Тогда Ansible вам в помощь.
▫️Не очень подходит если хосты с разными операционками. Некоторые библиотеки различаются для Linux и Windows (там, где есть бинарники) и приходится мудрить более сложные схемы.
#tricks#basic
✨Наша цифровая лаборатория получила новые сертификаты!
С радостью сообщаем, что в мае наша лаборатория прошла проверку и получила обновленные сертификаты качества (система сертификации Промтехстандарт).
Что это значит для вас:
• Уверенность в качестве исследований: вы можете быть уверены, что все исследования в нашей лаборатории проводятся в соответствии с международными стандартами качества
• Максимальная точность диагностики: мы используем передовые технологии и интегрированные IT-решения, чтобы обеспечить вам точные и надежные результаты исследований
• Профессиональный подход: наши специалисты – высококвалифицированные врачи с большим опытом работы в области патоморфологии
• Индивидуальный подход: мы готовы предоставить вам всю необходимую информацию об исследованиях и гибко подходить к решению ваших задач
С уважением,
UNIM – ваш надежный партнер в мире цифровой патоморфологии
#юним#digitalpathology#certification
✨ЮНИМ: Digital Pathology - "Продукт года" Digital Leaders 2024!✨
17 июня наш Digital Pathology одержал победу в престижной номинации "Продукт года" премии Digital Leaders!
Отбор проходил среди множества цифровых продуктов от ведущих компаний. Эксперты жюри высоко оценили инновационные решения и потенциал Digital Pathology в области медицины будущего.
Победа в Digital Leaders - это не просто признание, мы продолжим совершенствовать Digital Pathology, делая его еще более доступным и эффективным инструментом для врачей-патологов.
Наша цель - сделать диагностику более точной и быстрой.
Благодарим всех за поддержку!
#юним#digitalpathology#digitalleaders
Сегодня расскажем о важной услуге нашей лаборатории — фотосканирование микропрепаратов.
❓Что такое фотосканирование?
Фотосканирование, или сканирование микропрепарата, является ключевой частью цифровой патоморфологии. Этот метод позволяет получить цифровое изображение образца ткани для диагностики, второго мнения, удобного хранения и обмена данными.
Цифровое изображение микропрепарата имеет ряд преимуществ перед традиционной микроскопией:
✅Удобство: Анализ можно проводить без микроскопа, а доступ к изображениям возможен с любого места.
✅Качество: Высокое разрешение и сохранение качества при передаче данных.
✅Хранение: Цифровые слайды легче архивировать и искать.
Как это помогает врачам?
Фотосканирование особенно полезно, если нет возможности получить консультацию узкоспециализированного патоморфолога на месте. Цифровое изображение можно передать для второго мнения, включая зарубежных экспертов. Это повышает качество диагностики и снижает риски ошибок.
Цифровые изображения также используются для подготовки учебных материалов, видеоконференций и консилиумов.
В ЮНИМ мы активно используем эту технологию для обеспечения лучшего сервиса.
____________
Используете ли вы цифровую патоморфологию в своей практике? Делитесь опытом в комментариях!
#UNIM#цифроваяпатология#иммуногистохимия#онкология#медицина#юним#digitalpathology
Как правильно сформулировать клинический вопрос к патоморфологу?
Правильно сформулированный клинический вопрос – это ключ к получению точного и полезного патоморфологического заключения. От ясности и полноты вопроса зависит, насколько эффективно патоморфолог сможет помочь в диагностике и лечении пациента.
Как правильно сформулировать вопрос?
➡️Укажите локализацию процесса: Точно укажите орган или ткань, из которой взят материал для исследования.
➡️Опишите клиническую картину: Кратко опишите основные жалобы пациента, результаты физикального осмотра и данные дополнительных исследований (анализы, инструментальные методы).
➡️Выдвиньте предположительные диагнозы: Перечислите несколько наиболее вероятных диагнозов на основании клинических данных.
➡️Сформулируйте конкретный вопрос: Сформулируйте вопрос таким образом, чтобы он требовал конкретного ответа (например, "Является ли это новообразование доброкачественным или злокачественным?").
➡️Укажите дополнительные пожелания: Если у вас есть какие-либо дополнительные пожелания (например, необходимость проведения срочного исследования), укажите их.
Пример правильно сформулированного вопроса:
У пациента 55 лет обнаружено образование в правой доле печени. При ультразвуковом исследовании образование неоднородное, с четкими контурами. Биопсия печени выполнена пункционной иглой. Является ли это образование метастазом колоректального рака (у пациента в анамнезе колоректальный рак)? Необходимо ли провести иммуногистохимическое исследование на маркеры гепатоцеллюлярной карциномы и метастазов?
Цифровая платформа Digital Pathology может обеспечить в режиме реального времени общение между патоморфологом и клиницистом для повышение точности и скорости постановки диагноза.
Помните: сотрудничество клинициста и патоморфолога – это залог успешного лечения пациента.
#UNIM#цифроваяпатология#иммуногистохимия#онкология#медицина#юним#digitalpathology
Друзья,
Рады сообщить, что лаборатория UNIM успешно прошла независимую экспертизу качества иммуногистохимических исследований, проведенную Центром контроля качества РМАНПО.
Что это значит для вас?
🔘Высочайший уровень качества: Мы подтвердили, что наша лаборатория полностью соответствует мировым стандартам "идеального окрашивания". Это значит, что вы можете быть уверены в точности и надежности результатов наших исследований.
🔘Гарантия правильного диагноза: Даже при обнаружении незначительных отклонений от референсного показателя, наши специалисты проводят дополнительную верификацию, чтобы исключить нежелательных погрешностей в постановке диагноза.
🔘Ваш надежный партнер: Мы стремимся предоставлять вам самую точную и достоверную информацию, необходимую для принятия взвешенных клинических решений.
С уважением,
UNIM – ваш надежный партнер в мире цифровой патоморфологии.
#UNIM#цифроваяпатология#иммуногистохимия#качество#надежность#онкология#медицина#юним#digitalpathology#certification