Можно ли в Python создавать бинарные файлы? Конечно можно.
Для этого в Python есть следующие инструменты:
▫️ тип данных bytes и bytearray
▫️ открытие файла в режиме wb (write binary) или rb (read binary)
▫️ модуль struct
Про модуль struct поговорим в первую очередь.
Файл в формате JSON или Yaml внутри себя содержит разметку данных. Всегда можно определить где список начался а где закончился. Где записана строка а где словарь. То есть формат записи данных содержит в себе элементы разметки данных.
В binary-файле данные не имеют визуальной разметки. Это просто байты, записанные один за другим. Правила записи и чтения находятся вне файла.
Модуль struct как раз и помогает с организацией данных в таком файле с помощью определения форматов записи для разных частей файла.
Модуль struct преобразует Python-объекты в массив байт, готовый к записи в файл и имеющий определённый вид.
Для этого всегда следует указывать формат преобразования (или, как оно здесь называется - запаковки).
Формат нужен для того, чтобы выделить достаточное количество байт для записи конкретного типа объекта. В последствии с помощью того же формата будет производиться чтение.
При этом следует помнить что мы говорим о типах языка С а не Python.
Именно формат определяет, что записано в конкретном месте файла, число, строка или что-то еще.
Вот какие токены формата у нас есть.
Помимо этого, первым символом можно указать порядок байтов. На разных системах одни и те же типы данных могут записываться по-разному, поэтому желательно указать конкретный способ из доступных. Если этого не сделать, то используется символ '@', то есть нативный для текущей системы.
В строке формата мы пишем в каком порядке и какие типы собираемся преобразовать в байты.
Запакуем в байты простое число, токен "i".
>>> import struct
>>> struct.pack('=i', 10)
b'\n\x00\x00\x00'
Теперь несколько float, при этом нужно передавать элементы не массивом а последовательностью аргументов.
>>> struct.pack('=fff', 1.0, 2.5, 4.1)
b'\x00\x00\x80?\x00\x00 @33\x83@'
Вместо нескольких токенов можно просто указать нужное количество элементов перед одним токеном, результат будет тот же.
>>> struct.pack('=3f', 1.0, 2.5, 4.1)
b'\x00\x00\x80?\x00\x00 @33\x83@'
Теперь запакуем разные типы
>>> data = struct.pack('=fiQ', 1.0, 4, 100500)
я запаковал типы float, int и unsigned long long (очень большой int, на 8 байт)
b'\x00\x00\x80?\x04\x00\x00...'
Распаковка происходит аналогично, но нужно указать тот же формат, который использовался при запаковке. Результат возвращается всегда в виде кортежа.
>>> struct.unpack('=fiQ', data)
(1.0, 4, 100500)
Как видите, ничего страшного!
#lib#basic
Прервем молчание красивым графиком про ИМТ взрослого населения в СШАотсюда.
Что мне нравится на пикче: все.
Начнем с главного.
1. Мы видим двумерную гистограмму совместного распределения роста и веса; частота каждой клеточки передается ее размером.
2. ИМТ — это детерминистическая функция роста и веса; на основе него выделяют степени ожирения / дистрофии. Эти классы показаны тонкой пунктирной линией и дополнительно выделены цветом.
Пройдемся по деталям.
1. Отдельные квадратики перекрывают друг друга. Это не мешает восприятию и придает изюминку и ритм. У графика словно появляется материальное / физическое измерение, какая-то тактильность; как будто он составлен из карточек.
2. Обратите внимание, как показано разбиение на степени ожирения / дистрофии. Общий тон задают тоненькие линии; "карточки" нарисованы поверх линий, поэтому введена дополнительная цветовая кодировка.
3. Палитра офигенная: негромкая, не выжигает глаза, устойчива ко всем видам дальтонизма и переводу в ЧБ вид (чекал вот тут). Нормальный ИМТ закодирован белым — это же гениально.
4. На графике нет отдельной легенды: она вынесена в свободное место наверху и совмещена с информацией о том, какая часть взрослой популяции приходится на каждый класс ИМТ.
5. Очень читаемые и одновременно ненавязчивые оси. При этом помимо оси X (вес) и Y (рост) у нас появляется третья ось: класс ИМТ. Обратите внимание, как органично включены единицы измерения в подписи на осях.
6. Оценим рубленый моноширинный шрифт для самого графика. Главная мысль напечатана на самом графике шрифтом с засечками.
7. На графике указан источник данных.
Крч, вах-вах, очень хорошо, Nathan Yau (автор графика) — виртуоз, хочу такой постер. (Иллюстрация сделана в R и потом допилена в Adobe Illustrator).
#dataviz
Про оформление отчетов
Меня тут студенты спрашивали про то, до какого знака округлять и как оформлять таблички и чиселка в тексте. Собрал сколько-то источников с пояснениями, выложу и сюда тоже (да, я помню, что обещал про проверки на нормальность, к середине января распинаю проекты, закончится семестр и сяду писать текст =).
Вообще, это не то чтобы какие-то устоявшиеся правила, это скорее вопрос дизайна, верстки, типографики и стандартов принятых в журнале. У физиков есть какие-то там свои конвенции, но попытка их применить в биомедицинском журнале достаточно часто вызывает непонимание рецензентов (например, у физиков принято среднее и sd округлять до разного количества знаков; биомедикам такое не заходит). Поэтому вместо жестких рекомендаций посоветую штуки, которые можно почитать, чтобы понять, чем руководствоваться при принятии решений (то есть, как можно уточнить правило "верстайте хорошо, а плохо не верстайте"). Начнем с двух статей; в обоих случаях советую почитать также статьи из библиографии, которые они упоминают.
1. Rudiments of Numeracy, Ehrenberg, 1977 — задает самую базовую рамку для верстки таблиц. Очень советую всем, хорошо написано, вынес оттуда много важного, а еще там очень красиво и минималистично. Рекомендасьон.
2. A Case for Simple Tables, Martin Koschat, 2005 — похожий текст, но поновее. На мой вкус, труба пониже, дым пожиже.
Из более объемных текстов можно посмотреть в сторону книжек Tufte; начните с The visual display of quantitative information, 2nd ed., 2007. Там про графики и иллюстрации вообще, но есть и про таблички. Автора люто-бешено котируют ребята из Бюро Горбунова и дизайнеры вообще.
Из более фастфудного: можно погулять по каналу и блогу Ильи Бирмана, он часто пишет про представление информации и таблички. В качестве стартовой точки можете взять вот этот список коротких видосиков с его курса про интерфейс и представление информации, минимум треть из них релевантна и для нас, пишущих и верстающих отчетики.
Есть специальный канал табличный дизайн, там прицельно про это пишут. У них же есть табличный курс, я фоново имею в плане на него сходить, когда будет время и настроение. Я про них писал в первом посте на канале.
Ну и можете погуглить всякие стайлгайды, госты и руководства для инженеров, физиков и верстальщиков, там наверняка этот вопрос будет освещен и нормирован.
А еще 31.12 активной жизни канала исполнился год. Ура и вау, то ли еще будет! 🙏
#dataviz#tables
«Основы визуализации данных» Клауса Уилке
Наконец-то вышел русскоязычный перевод книги Клауса Уилке «Основы визуализации данных» — это настоящая кладезь знаний для всех, кто хочет овладеть искусством и наукой визуализации данных. Автор, профессор интегративной биологии, обладает уникальной способностью объяснять сложные концепции простым и доступным языком, что делает книгу полезной как для новичков, так и для опытных специалистов.
С самого начала Уилке подчеркивает важность правильного отображения данных. Он отмечает, что визуализация данных — это не просто способ сделать отчеты более красивыми, но и мощный инструмент для анализа и коммуникации, способный существенно повлиять на интерпретацию информации. Автор проводит читателя через все этапы создания визуализации, от выбора правильного типа диаграммы до настройки осей и использования цветовых схем.
Одним из главных достоинств книги является ее структурированность и систематичность. Каждая глава посвящена отдельному аспекту визуализации, начиная с базовых принципов и заканчивая более сложными техниками. Например, глава, посвященная цветовым схемам, предоставляет исчерпывающие рекомендации по выбору и использованию цветов, учитывая как эстетические, так и функциональные аспекты. Уилке подробно объясняет, как различные цветовые схемы могут влиять на восприятие данных и как избежать распространенных ошибок, таких как чрезмерное использование цветов или недостаточное внимание к людям с дальтонизмом.
Большое внимание уделяется также выбору правильных типов диаграмм для различных типов данных. Автор приводит множество примеров, показывая, какие визуализации наиболее эффективны для представления количественных, категориальных или временных данных. Практические советы и примеры помогают читателю лучше понять, как применять теоретические знания на практике.
Все графики в книге подготовлены с помощью R и ggplot2, но вы не найдете ни строчки кода в книге. Можно отдельно посмотреть код самой книги, так и отдельных графиков.
Похвалы заслуживает глава, посвященная распространённым ошибкам в визуализации данных. Уилке подробно разбирает типичные ошибки, такие как избыточное использование трёхмерных графиков или отсутствие контекста, и предлагает практические решения для их избегания. Это делает книгу не только учебным пособием, но и ценным справочником, к которому можно обращаться в процессе работы.
В целом, «Основы визуализации данных» Клауса Уилке — это обязательное книга для всех, кто работает с данными и хочет научиться представлять их максимально эффективно и понятно. Книга сочетает в себе глубокие теоретические знания и практические советы, что делает её незаменимым инструментом для анализа и визуализации данных. Она помогает не только создавать красивые графики, но и делать ваши данные понятными и убедительными, что особенно важно в эпоху информационного перегруза.
#книги#dataviz#R#ggplot2#ВизуализацияДанных
Mapa anual de los patrones migratorios de las aves acuáticas en América del Norte https://t.co/j5A3xdWORH#science#bird#dataviz#map#ornithology@Team_eBirdhttps://t.co/nop8nTUCzbhttps://twitter.com/jm22381/status/1230853108915408899
🤖Краш-тест возможностей chatGPT-4 для создания визуализации данных в R с помощью ggplot2
GPT-4 можно использовать для улучшения визуализации данных в R (ggplot2), что делает его отличным инструментом как для начинающих, так и для продвинутых пользователей R. Мне понравилось, как автор видео общается с chatGPT-4. Хотя код на R иногда содержит ошибки и не работает, весь процесс выглядит очень захватывающим. От создания базовых графиков (смотрите с какой легкостью chatGPT пишет код для пайчарта 🙊 на зависть новичкам) до продвинутых техник использования ChatGPT для поиска данных, анализа и визуализации данных.
▶️ВидеоUsing GPT-4 for Data Viz (R/ggplot).
Мораль: Как мне кажется, с появлением AI люди НЕ потеряют способность к абстрактному мышлению, анализу, или креативность. Использование chatGPT только повысит производительность труда и качество работы человека.
#R#ggplot2#chatGPT4#визуализация_данных#dataviz#полезное
#DataScience#rstats#DataScientist#dataanalysis#r#programming#dataviz#statistics
In an era driven by data, harnessing the power of statistics is key to deriving meaningful insights from the vast sea of information around us.
pyoflife.com/statistics-wit
-----
Main channel: @repo_science
Coupons: @freecoupons_reposcience
-----
#ML#datascience#rstats#programming#dataviz#stats#analytics#machinelearning
6 formas de visualizar los resultados del análisis cluster jerárquico con R
-----
Main channel: @repo_science
Coupons: @freecoupons_reposcience
-----
🤔 А вы знали, что в Microsoft Excel есть встроенная функция 3D-карт? Она позволяет визуализировать данные, размещая их на модели земного шара.
Об этом рассказала японская энтузиастка Excel под ником Tsutsui0524, которая состоит в профильном Discord-сообществе пользователей, глубоко работающих с таблицами.
Учитывая, что Excel во многом лежит в основе мировой экономики, наличие таких инструментов уже не кажется неожиданным — хотя всё
равно вызывает удивление.
#Excel#Технологии#ВизуализацияДанных#DataViz#ЦифровыеИнструменты#IT#РаботаСДанными#БизнесИнструменты#Интересно#ФункцииExcel
#programming#GPT4#GPT3#dataviz#stats#analytics#ML#AI#IA
🚀
Cómo programar más rápidamente en #RStats con #ChatGPT
Escribir código es un proceso lento, especialmente cuando estás aprendiendo #datascience por primera vez. ¿Y si pudieras acelerarlo?
🔗Link
-----
Main channel: @repo_science
Coupons: @freecoupons_reposcience
-----