Најди сличен содржај

Изворен канал @pythonotes · Post #241 · 5 мај

Можно ли в Python создавать бинарные файлы? Конечно можно. Для этого в Python есть следующие инструменты: ▫️ тип данных bytes и bytearray ▫️ открытие файла в режиме wb (write binary) или rb (read binary) ▫️ модуль struct Про модуль struct поговорим в первую очередь. Файл в формате JSON или Yaml внутри себя содержит разметку данных. Всегда можно определить где список начался а где закончился. Где записана строка а где словарь. То есть формат записи данных содержит в себе элементы разметки данных. В binary-файле данные не имеют визуальной разметки. Это просто байты, записанные один за другим. Правила записи и чтения находятся вне файла. Модуль struct как раз и помогает с организацией данных в таком файле с помощью определения форматов записи для разных частей файла. Модуль struct преобразует Python-объекты в массив байт, готовый к записи в файл и имеющий определённый вид. Для этого всегда следует указывать формат преобразования (или, как оно здесь называется - запаковки). Формат нужен для того, чтобы выделить достаточное количество байт для записи конкретного типа объекта. В последствии с помощью того же формата будет производиться чтение. При этом следует помнить что мы говорим о типах языка С а не Python. Именно формат определяет, что записано в конкретном месте файла, число, строка или что-то еще. Вот какие токены формата у нас есть. Помимо этого, первым символом можно указать порядок байтов. На разных системах одни и те же типы данных могут записываться по-разному, поэтому желательно указать конкретный способ из доступных. Если этого не сделать, то используется символ '@', то есть нативный для текущей системы. В строке формата мы пишем в каком порядке и какие типы собираемся преобразовать в байты. Запакуем в байты простое число, токен "i". >>> import struct >>> struct.pack('=i', 10) b'\n\x00\x00\x00' Теперь несколько float, при этом нужно передавать элементы не массивом а последовательностью аргументов. >>> struct.pack('=fff', 1.0, 2.5, 4.1) b'\x00\x00\x80?\x00\x00 @33\x83@' Вместо нескольких токенов можно просто указать нужное количество элементов перед одним токеном, результат будет тот же. >>> struct.pack('=3f', 1.0, 2.5, 4.1) b'\x00\x00\x80?\x00\x00 @33\x83@' Теперь запакуем разные типы >>> data = struct.pack('=fiQ', 1.0, 4, 100500) я запаковал типы float, int и unsigned long long (очень большой int, на 8 байт) b'\x00\x00\x80?\x04\x00\x00...' Распаковка происходит аналогично, но нужно указать тот же формат, который использовался при запаковке. Результат возвращается всегда в виде кортежа. >>> struct.unpack('=fiQ', data) (1.0, 4, 100500) Как видите, ничего страшного! #lib#basic

Hashtags

#lib #basic

Резултати

Пронајдени 2 слични објави

Пребарај: #genomics

当前筛选 #genomics清除筛选

Куратор из ЛСБ

@lsbcurator · Post #147 · 02.03.2024 г., 19:52

Најди слично Погледај

#biology#genomics Неживая биологическая сущность нового типа обнаружена в микробиоме человека До недавнего момента в природе было известно четыре неживых биологических сущности: 1. Вирус — кусок ДНК/РНК в белковой оболочке, транслируется в белок, размножается за счёт машинерии в клетке. Достаточно сложная штука по сравнению с остальными пунктами в списке. 2. Вироид: маленький реплицирующийся кусок РНК, ~300 оснований. Для сравнения s-протеин коронавируса ~3300 оснований, сам коронавирус ~30'000 оснований, то есть в сто раз больше. Не транслируется в белок. Размножается за счёт клетки. Обладает рибозимной активностью, то есть может реплицировать сам себя. Потенциальный остаток гипотетического «мира РНК» — самой ранеей стадии эволюции жизни, на которой доминировала РНК и ещё не существовало ДНК. Патоген для растений — вредитель картофеля. Общепринятое название может сбивать с толку, так как вироиды не относятся к вирусам. 3. Сателлитная РНК. Тоже реплицирующийся кусок РНК. Отличия от пункта 2 в том, что не обладает рибозимной активностью, то есть не может реплицировать сам себя. Может реплицировать себя только с помощью РНК-зависимой РНК-полимеразы какого-то вируса. То есть сателлитная РНК это паразит вируса. upd. 4. Прионы: неправильно свернутые белки. В отличие от других объектов в этом списке, прионы не содержат никакого генетического материала. Они заставляют нормальные белки того же типа принимать свою неправильно свернутую структуру, что приводит к каскаду клеточных повреждений. Прионные заболевания, такие как болезнь Крейтцфельдта-Якоба (БКЯ) у людей и губчатая энцефалопатия крупного рогатого скота («коровье бешенство») являются нейродегенеративными и смертельными. Это делает прионы уникальными, поскольку они представляют собой просто инфекционные белковые структуры. Новый: 5. Обелиск (Obelisk). Тоже реплицирующийся кусок РНК, ~1000 оснований. Похожей РНК в базах нет, транслируется в белки облины (oblins), похожих на которые тоже в базах нет. Назначение белков неизвестно. РНК кольцевая, механизм трансляции в белок делает сколько-то оборотов, потом один большой кусок аминокислотной последовательности нарезается на белки, 1 оборот -> 1 молекула белка, как понимаю. https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.20.576352v1

Hashtags

#biology #genomics

GitHub Trends

@githubtrending · Post #15534 · 01.03.2026 г., 12:00

Најди слично Погледај

#python#agent_skills#ai_scientist#bioinformatics#chemoinformatics#claude#claude_skills#claudecode#clinical_research#computational_biology#data_analysis#drug_discovery#genomics#materials_science#metabolomics#proteomics#scientific_computing#scientific_visualization Claude Scientific Skills offers 148+ ready-to-use tools for AI agents like Cursor or Claude Code, covering biology, chemistry, drug discovery, clinical research, ML, and 250+ databases (PubMed, ChEMBL, etc.). Easy setup: clone the GitHub repo and copy folders to your skills directory for automatic use in complex workflows like single-cell analysis or virtual screening. You save days on setup, get reliable code, and run multi-step science faster on your desktop. https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills

Hashtags