Evolutionary Genomics | Akbarjon Rozimov

Bugun sizlarga qanday qilib annotatsiya qilingan fasta fayldan kerak gen qismini alohida ajratib olishni ko'rsataman. Tasavvur qiling 37 ta annotatsiya qilingan gen fasta fayli bor, va aynan sizga faqat COI gene kerak. Buni hech qanday kodsiz shunday copy va paste qilib olish ham mumkin, ammo sizda bir nechta o'nlab yoki yuzlab fasta fayllar bo'lsa bu juda ko'p vaqt saqlash noto'g'ri. Shunday payti python kodlar yodamida xohlagancha fasta fayldan xohlagancha gen qismlarini sekundlar ichida ajratib olishingiz mumkin. Yuqoridagi python skriptda aynan qanday qilib annotatsiya qilingan fasta fayldan COI genni ajratib olib, to'g'ri identifayr yozishni o'rganishingiz mumkin. Va ajratib olingan gen uzunligini seqkit yordamida uzunligini, va head yordamida identifayr to'g'ri yozilganmi ko'rishingiz mumkin. #Extract_gene #Python https://t.me/EvolutionaryGenomics