ИППИ РАН

Объявляем эту неделю марафоном подачи заявок накурсы, школы и конференции! 📣 Объявление #1 Что: Курс«Высокопроизводительные методы анализа генома» Где: Сколтех Когда: 2.09.2023 — 16.12.2023, по субботам (кроме 4.11), 8 академ. часов с перерывом на обед Что будет: Будут рассмотрены такие темы как платформы высокопроизводительного секвенирования 2-го и 3-го поколений, их физико-химические принципы, возможности и ограничения, сборка геномов и транскриптомов de novo, картирование и поиск генетических вариантов, анализ экспрессии с помощью секвенирования РНК, метагеномика и метабаркодинг, анализ родственных взаимосвязей на основании последовательностей ДНК и другие. При рассмотрении разделов будет уделяться особое внимание особенностям, характерным для геномов растений. Все темы будут сопровождаться практическими занятиями с анализом реальных данных. Курс будет предваряться занятиями, посвященными работе в командной строке Linux и дополнительными занятиями по основам статистики в R. Занятия будут проводить сотрудники Сколтеха, ИППИ РАН и МГУ: Мария Логачёва, Алексей Пенин, Анна Клепикова, Денис Омельченко, Михаил Щелкунов, Тагир Самигуллин. Занятия проводятся на бесплатной основе, при поддержке Минобрнауки России. Со слушателями будет заключен договор, а по окончании всем успешно прошедшим курс будет выдан сертификат о повышении квалификации. Условия участия: Необходимо заполнить форму в срок до 1 августа 2023 года. Число мест на курсе ограничено. В случае превышения числа заявок над числом мест приоритетное зачисление будет предоставляться слушателям, работающим в области биологии растений. Информация о зачислении на курс будет предоставлена не позднее 15 августа 2023 года. Участие в курсе возможно только при наличии бакалаврского диплома или более высокой ступени образования. Для занятий необходимо иметь свой ноутбук с операционной системой Windows (использование компьютеров Apple возможно, но нежелательно и может приводить к затруднению работы с некоторыми программами) и обладать знаниями по молекулярной биологии и генетике в объеме следующих курсов: https://stepik.org/course/70/promo и https://stepik.org/course/9180/promo. Если вы сомневаетесь в своих знаниях, рекомендуем пройти эти курсы до начала занятий. Отсутствие опыта работы в командной строке и в среде R не является препятствием для прохождения курса.

В ИППИ РАН началась летняя школа для студентов Физтеха Июль — время, когда студентов в Институте больше, чем сотрудников, разъехавшихся по отпускам. Это бакалавры МФТИ, поступившие на базовую кафедру ИППИ, проходят летнюю школу, она же стажировка. На весь месяц студенты становятся полноправными членами научных групп и лабораторий Института. Многие из них после перейдут уже в штат. В этом году 35студентов распределены по семи лабораториям и отдельным научным группам. В течение школы студенты работают над задачами, взятыми из текущих исследовательских и прикладных проектов, под чутким наблюдением и при содействии кураторов из числа сотрудников Института. Кураторы и студенты — будущие соавторы, т.к. конечная цель школы — полученный результат оформить в статью, а статью представить на ежегодной школе-конференции «Информационные технологии и системы», которая будет пройдет в сентябре. Для этого недостаточно разбираться в самом предмете исследования. В лаборатории беспроводных систем проводят целую серию мастер-классов по практическим навыкам научной работы: как поставить эксперимент, как написать хорошую статью, как сделать запоминающийся доклад — то, чему не учат в университетах. Летняя школа проходит в ИППИ каждый год, но, пожалуй, впервые исследовательская практика подкреплена продуманной учебной программой. Студентам, обучающимся по направлению «анализ данных», читают курсы по математической статистике, вычислительной линейной алгебре и анализу изображений. Кроме того, они проходят интенсивный курс по программированию на Python. #ИППИjunior

❗️РНФ объявил конкурсы отдельных научных групп, междисциплинарных проектов, а также конкурсы продления реализации проектов ✅«Проведение фундаментальных и поисковых научных исследований отдельными научными группами» Гранты выделяются на осуществление научных исследований в 2024 – 2026 годах с последующим возможным продлением срока выполнения проекта на один или два года по всем отраслям знаний. Размер одного гранта составляет от 4 до 7 млн рублей ежегодно. 📌 Заявка на конкурс представляется не позднее 17 часов 00 минут (по московскому времени) 15 ноября 2023 года через ИАС РНФ. ✅«Проведение фундаментальных и поисковых научных исследований по поручениям (указаниям) Президента РФ» (междисциплинарные проекты) Гранты выделяются на осуществление научных исследований в 2024 – 2027 годах с последующим возможным продлением срока выполнения проекта на три года по всем отраслям знаний. Размер одного гранта составляет от 8 до 15 млн рублей ежегодно. 📌 Заявка на конкурс представляется не позднее 17 часов 00 минут (по московскому времени) 15 ноября 2023 через ИАС РНФ. ✅Продление конкурса «Проведение фундаментальных и поисковых научных исследований отдельными научными группами» В конкурсе могут принимать участие проекты научных групп, являющиеся продолжением проектов, поддержанных в 2021 году. Размер одного гранта на реализацию проекта в 2024-2025 годах составит от 4 до 7 млн рублей ежегодно. ✅Продление конкурса «Проведение фундаментальных и поисковых научных исследований по поручениям (указаниям) Президента РФ» (междисциплинарные проекты) В конкурсе могут принимать участие междисциплинарные проекты научных коллективов, являющиеся продолжением междисциплинарных проектов, поддержанных в 2020 году. Размер одного гранта на реализацию проекта в 2024-2026 годах составит от 4 до 7 млн рублей ежегодно. 📌 Заявки на продление представляется не позднее 17 часов 00 минут (по московскому времени) 21 декабря 2023 года через ИАС РНФ. Полная документация представлена в разделе «Конкурсы» на сайте РНФ. #новости_фонда

#семинары на этой неделе ЧЕТВЕРГ ◼️15:00, зал заседаний ученого совета ИППИ + онлайн-трансляция Семинар лаборатории зрительных систем Доклад #1 Докладчик: Данил Казимиров (ИППИ РАН, МГУ) Тема: Метод автоматического определения и коррекции параметров положения оси вращения в компьютерной томографии с помощью усредненного изображения проекций Аннотация: Положение оси вращения объекта является важным параметром алгоритмов томографической реконструкции. Из-за использования неточно определенного значения этого параметра на границах реконструированных слоев томографированного объекта возникают артефакты в виде полосоподобных искажений, раздвоений и размытий (артефакты типа камертона). Существующие методы поиска и коррекции положения оси вращения для компьютерной томографии требуют большого количества вычислительных ресурсов, трудоемки в реализации и не позволяют точно определить сразу несколько параметров положения оси, т.е. задача разработки методов по-прежнему актуальна. В докладе будет рассказано о модели параметризации положения оси вращения, обоснование модели и разработанном методе автоматического определения параметров оси вращения. Апробация метода выполнена как на синтетических, так и на реальных данных в параллельно-лучевой и конусно-лучевой геометрических схемах. Доклад #2 Докладчик: Дмитрий Сидорчук (ИППИ РАН) Тема: Компенсация цветной дымки на данных дистанционного зондирования Земли Аннотация: В докладе будет предложено новое обоснование ранее опубликованного (в сборнике трудов конференции ИТИС) алгоритма компенсации цветной дымки для трёхканальных RGB изображений. Планируется новая публикация и мы работаем над расширением результатов на случай цветной дымки на мультиспектральных данных. А именно: идет разработка физически обоснованного генератора синтетической цветной мультиспектральной дымки. Также планируется тестирование с его помощью известных алгоритмов компенсации бесцветной мультиспектральной дымки.

Конференция памяти математика В.А. Малышева: 26-30 июня, мехмат МГУ + Zoom На следующей неделе на мехмате МГУ будет проходить конференция «В вечном поиске: математика, физика, жизнь», посвященная 85-летию Вадима Малышева (1938-2022). В программе конференции — доклады Альберта Ширяева, Анатолия Вершика, Семёна Шлосмана, Ги Файоля, Станислава Молчанова. Ознакомиться с программой и зарегистрироваться можно на сайте конференции: http://malyshev85.org/ Вадим Александрович — доктор физико-математических наук, профессор, основатель Лаборатории больших случайных систем при кафедре теории вероятностей МГУ, математик мирового уровня в области теории вероятностей и математической физики.

В ИППИ РАН образована новая лаборатория математических основ машинного обучения, которая будет специализироваться на математической статистике и математических методах анализа данных и оптимизации. Лабораторию возглавит доктор физико-математических наук Александр Гасников, профессор Физтех-школы прикладной математики и информатики и Факультета компьютерных наук НИУ ВШЭ, главный научный сотрудник Сколтеха. Новая лаборатория позволит укрепить и без того тесное сотрудничество ИППИ с ведущими вузами Москвы. Александр Гасников о новой лаборатории: «В наших планах — развивать сотрудничество с индустриальными партнерами, в частности, с Яндекс и Хуавей. Кроме того, мы стремимся усилить вполне успешно функционирующий механизм взаимовыгодного сотрудничества ИППИ с вузами, откуда в лабораторию могут приходить молодые ученые. А также постараться найти интересные темы для совместных исследований с другими активными группами ученых ИППИ РАН, в работе которых требуется анализ данных и оптимизация. Но хотелось бы подчеркнуть, что несмотря на мотивацию решатьпрактически важные задачи, лаборатория планирует в основном сосредотачиваться на исследованиях, в которых имеется хорошая научная составляющая, позволяющая математически строго обосновывать эффективность тех или иных предлагаемых решений». С начала 2000-х годов ИППИ РАН стал выступать межинститутской площадкой для организации научных мероприятий самого высокого уровня по теме машинного обучения и оптимизации. Читайте далее и узнаете больше о семинаре «трёх оракулов», анализе нейроданных и других историях о Data Science в ИППИ!

#семинары на этой неделе ЧЕТВЕРГ ◼️15:00, зал заседаний ученого совета ИППИ + онлайн-трансляция Семинар лаборатории зрительных систем Представление выпускных квалификационных работ студентов кафедры когнитивных технологий. На семинаре трое студентов кафедры когнитивных технологий МФТИ представят свои выпускные квалификационные работы, выполненные под руководством и.о. м.н.с. лаборатории зрительных систем ИППИ РАН, н.с. ФИЦ ИУ РАН, к.т.н. Елены Лимоновой на темы: ▪️«Методы обучения вычислительно- и аппаратно-оптимальных нейросетевых моделей на примере биполярных морфологических нейронных сетей» (Михаил Зингеренко, 6 курс); ▪️«Создание вычислительно-оптимальных малобитных нейросетевых моделей для процессоров общего назначения с низкой потребляемой мощностью» (Артём Шер, 6 курс); ▪️«Обучение бинарных нейросетевых моделей с помощью непрерывных аппроксимаций» (Дмитрий Павлюченков, 4 курс). ПЯТНИЦА ◼️17:00, онлайн-заседание в Skype Московский телекоммуникационный семинар | http://wireless.iitp.ru/seminar Докладчик: Сергей Петров, ИВМ РАН Тема: Эффективные методы приближения матриц и тензоров в условиях неполных и зашумленных данных Аннотация: В докладе будут рассмотрены свойства канала беспроводной связи, рассмотренного в формате многомерного тензора: такой тензор, согласно многолучевой модели, обладает ’хорошим’ приближением малого канонического ранга. Будет показано, что использование канонических приближений тензора канала позволяет эффективно решать задачи оценки и сжатия канала, так как канонический формат является малопараметрическим и обладает высокой устойчивостью к неточностям измерений. В частности, будут представлены аналитические оценки, показывающие зависимость устойчивости канонического тензора малого ранга к шуму от его размерности, а также рассмотрен алгоритм предсказания канала на основе экстраполяции канонических факторов, поддерживающий приемлемую точность на 20-160 миллисекунд вперед. Для участия в семинаре необходимо заполнить Google-форму.

Ночная фотография: как научить камеру сразу делать красиво? Все три вышеперечисленных фактора делают задачу формирования изображений ночных сцен настоящей головоломкой. При ночной съемке алгоритмы фотокамер пока что плохо справляются с оценкой исходного…

#семинары на этой неделе ЧЕТВЕРГ ◼️15:00, зал заседаний ученого совета ИППИ + онлайн-трансляция Семинар лаборатории зрительных систем Докладчик: Антон Трусов (МФТИ, ФИЦ ИУ РАН, Smart Engines) Тема: Методы быстрого вычисления квантованных сверточных нейронных сетей на центральных процессорах Аннотация: В последние годы сверточные нейронные сети стали де-факто стандартным инструментом в задачах распознания, синтеза и сложной обработки изображений. Часто такие задачи необходимо решать в условиях ограничений на время исполнения, вычислительную сложность и объем используемой памяти, особенно для работы в режиме реального времени на мобильных и встраиваемых устройствах. В этом случае может помочь квантование нейронной сети — замена вещественных значений на дискретные. На данном семинаре будут рассмотрены методы быстрого вычисления квантованных нейронных сетей на центральных процессорах (ЦПУ), ориентированные на использование на мобильных устройствах. 🔵Сначала мы рассмотрим быстрые способы вычисления дискретной свертки на ЦПУ, включая алгоритмы почти не прямой свертки и p-im2col. 🔵Затем мы перейдем к квантованным нейронным сетям. Рассмотрим широко используемое 8-битное линейное квантование, которое уже стало стандартом при имплементации вычислительно эффективных нейронных сетей. 🔵Наконец, рассмотрим способы быстрого вычисления мало-битных: 4-битных, тернарных, бинарных и тернарно-бинарных нейронных сетей.

«Теория чисел и геометрия» — конференция памяти Алексея Зыкина В этот четверг, в Математическом институте им. В.А. Стеклова пройдет VII мемориальная конференция «Теория чисел и геометрия», посвященная памяти Алексея Зыкина (1984-2017). Конференция начнется в полдень и будет проходить в гибридном формате, все доклады будут транслироваться в Zoom. Адрес МИАН: ул. Губкина, 8, аудитория 104. В программе дня — доклады Петра Кучерявого, Андрея Трепалина, Екатерины Малыгиной и Алексея Пирковского. Расписание докладов и аннотации, а также форма регистрации доступны на сайте: https://zykin.mccme.ru/. Алексей Зыкин — выпускник НМУ и мехмата МГУ, получил степень PhD в математическом институте Люмини (Марсель). Он был профессором университета Французской Полинезии, где руководил лабораторией GAATI (алгебраическая геометрия и приложения к теории информации); также работал в русско-французской лаборатории Понселе и в секторе алгебры и теории чисел ИППИ РАН (теперь это лаборатория). Работы Алексея Зыкина были удостоены премии Московского математического общества 2011 года. Он также был победителем конкурсов фонда Династия и фонда Саймонса. Алексей трагически погиб в 32 года, вместе с женой и инструктором, во время глубоководного погружения у острова Туамоту во Французской Полинезии.

#научные_новости Стрекающие (кишечнополостные) — это тип беспозвоночных животных, обитающих в воде, к которому относятся гидры, медузы и коралловые полипы, а также паразитические формы, такие как полиподии (живут в икре некоторых рыб) и сильно упрощенные Myxozoa, паразитирующие на рыбах и некоторых червях. Несколько лет назад авторы исследования обнаружили, что один из подклассов Myxozoa под названием Myxosporea удивителен тем, что у них отсутствует огромное количество генов, отвечающих за апоптоз — запрограммированную клеточную гибель. Этот универсальный для животных механизм позволяет устранять опасные клетки, накопившие слишком большое количество мутаций или иных повреждений. Раковые клетки в ходе их патологической эволюции утрачивают гены-активаторы апоптоза. А изученные представители Myxosporea растеряли такие гены на фоне сильного упрощения строения тела. Была выдвинута версия, что Myxosporea могут быть потомками «сбежавших» раковых клеток. О том, подтвердилась ли эта гипотеза — читайте по ссылке. Промежуточные результаты исследований опубликованы в журнале Scientific Reports (издательская компания Nature Portfolio).

Сегодня в 14:00 на математическом факультете ВШЭ начнется День Арнольда. Зарегистрироваться Академик Владимир Арнольд (1937-2010) — выдающийся математик, лауреат многочисленных премий. Работал в Москве (в МИАН и МГУ) и в Париже, возглавлял Московское математическое общество. Автор более 500 статей и около 50 книг. Он один из создателей теории особенностей, находящей многочисленные приложения как в математике, так и вне нее; один из авторов знаменитой теории КАМ (Колмогорова — Арнольда — Мозера). Владимир Игоревич внес огромный вклад в множество разделов математики. Его имя — во многих названиях теории динамических систем: теорема Лиувилля–Арнольда, язык Арнольда, диффузия Арнольда, кошка Арнольда (она же — окрошка) и т.д. А еще в честь него названа одна из малых планет — «Владаарнольдо». Владимир Арнольд – один из основателей Независимого московского университета, уникального учебного заведения, открывшегося в 1991 по инициативе математиков-энтузиастов. В число основателей НМУ входят такие важные для ИППИ люди как Роланд Добрушин, Яков Синай и Александр Кириллов.