Прецизионная онкология

Нам нужна ваша помощь для подготовки РОК-2023! Наша команда сейчас активно готовит материал для сессии “Что должен знать клиницист об особенностях и типичных ошибках при проведении молекулярного тестирования?” в рамках РОК-2023. Одной из “горячих” тем последних лет является определение HRD статуса опухоли, а также тестирование нарушений в генах HRR (BRCA1/2, PALB2 и прочие). Один из докладов сессии будет посвящен этой теме – методологическим и практическим аспектам HRD тестирования. Мы хотим разобрать самые интересные или сложные аспекты, и поэтому нам нужна помощь! Что вам было бы интересно услышать в рамках доклада? Ответами на вопросы ниже вы поможете сформировать программу РОКа:

📰Сегодня директор ОнкоАтлас Владислав Милейко выступил с докладом на V Всероссийской конференции с международным участием «Опухолевые маркеры: молекулярно-генетические и клинические аспекты», которая сейчас проходит в Горно-Алтайске. В своем докладе Владислав выдвинул следующие тезисы: 🔹NGS-тесты отличаются по надежности и точности – это можно оценить по косвенным признакам. 🔹Среди важных технических параметров: равномерность покрытия и длина ампликонов. 🔹Анализ данных – заключительный этап, который лежит на совести производителя теста. Делимся фотографиями выступления✅

Дорогие коллеги! 🧬 ОнкоАтлас поздравляет вас с профессиональным праздником — Днем медицинского работника! 🎉 Желаем успехов в профессиональной деятельности, личного счастья и семейного благополучия. Спасибо вам за ваш самоотверженный труд, за спасение жизней, исцеление от болезней, за то, что дарите счастье и надежду. 🏋‍♀Будьте здоровы!

Хоть сейчас и сложно оттянуть внимание с проходящего ASCO, но мы попробуем 💪 В JCO Precision oncology вышел новый обзор на тему MSI, посвященный методологическим трудностям определения MSI с помощью NGS. Это большая победа нашего отдела R&B - в этом журнале мы давно хотели опубликоваться, и вот наконец) https://ascopubs.org/doi/abs/10.1200/PO.23.00010

👥На прошлой неделе прошла 11-я всероссийская научно-практическая конференция центров геномных исследований мирового уровня. Ставшее традиционным мероприятие, по сути, превратилось в площадку по обмену опытом между специалистами в области геномных исследований и редактирования генома. И мы не упустили возможность поделиться своим опытом. Валентина Якушина, кандидат медицинских наук, главный специалист Отдела исследований и биоинформатики ОнкоАтлас, в своем выступлении рассказала про нашу тест-систему для определения микросателлитной нестабильности. Команда валидировала новый, готовый для использования в клинике, продукт, который по своим характеристикам не только превосходит базовые тесты, но и не уступает FoundationOne, а в чем-то даже его превосходит. Сразу скажем, что с цифрами вернемся к вам чуть позже, сразу как опубликуем. 🔷А еще своим докладом мы хотели привлечь онкологов к нашему исследованию “Динамика микросателлитной нестабильности и молекулярно-генетического профиля колоректального рака в ходе иммунотерапии”, его поддержал РНФ (22-75-10154) и мы продолжаем набор пациентов. На все вопросы с удовольствием ответит координатор Екатерина Белова, пишите ей сюда: [email protected]

🔷Друзья, наконец готовы фото со Школы по биоинформатике при поддержке ОнкоАтласа , которая прошла 24 апреля в Уфе. Найти их можно в этой папке. 🔷Лекции с презентациями в скором времени будут доступны в нашем канале на YouTube и ВКонтакте.

🩺Современному врачу не позавидуешь: он тоже живет в мире больших данных где пресловутая "big data" наступает со всех сторон, постоянно множится и формирует при этом одну из основ медицинских знаний. К частному случаю "big data", с небольшим допущением, мы отнесем "данные реального мира" - real world data (RWD), согласно определению FDA это данные о здоровье пациента и/или процессе оказанания медицинской помощи, которые собираются из разнообразных источников на постоянной основе. Сюда относится вообще все, что связано с пациентом: клинические, радиологические, патоморфологические, биохимические, популяционные, молекулярные данные - все это про RWD. Кстати, активность в социальных сетях, например, и информация с носимых электронных устройств тоже сюда относится. RWD нужны, чтобы их анализировать и генерировать RWE, real world evidence - "доказательства реального мира", которые, в отличие от рандомизированных контролируемых исследований (RCT), показывают как оно все обстоит на самом деле, а не в идеальной исследуемой популяции. Если серьезно: RWE круто дополняют RCT, а вот как именно расскажет Максим Иванов, к.б.н., руководитель R&D-отдела ОнкоАтлас. 🔵2 июня в Технопарке «Ленполиграфмаш» на VIII Телемедоруме анонсируем релиз платформы AVES - наша команда взяла на себя работу по анализу RWD и синтезу RWE для реализации прецизионного подхода в онкологии. Врачу остается только 4 раза кликнуть мышью в интуитивно понятном интерфейсе, остальное сделаем мы.