Прецизионная онкология

Хорошие новости для нас, как производителей и поставщиков тест-систем для NGS в лаборатории, работающие в системе ОМС. По сути уже сегодня централизация сложных МГИ работает на сокращение сроков выдачи результатов. Например, мы с 2021 года поддерживаем программу логистики биоматериала из любого региона для NGS-исследования BRCA1/2 в 3 лаборатории. Чтобы отправить образец, достаточно зарегистрироваться в программе и вызвать курьера. Полную инструкцию можно посмотреть здесь. Так что если вы хотите отправить образцы на исследование по ОМС, не стоит ждать нового регламента - присоединяйтесь к программе уже сейчас!

Часть 2: разбираемся с колоноскопией Колоноскопия один из базовых скрининговых методов вот уже много лет. Цифры говорят сами за себя – заболеваемость КРР при таком скрининге снижается на 40-69%, а риск смерти – на 29-88% . Однако результаты большого исследования NordICC озадачили профессиональное сообщество и потребовали заново ответить на вопрос «а так ли эффективен скрининг с помощью колоноскопии?». Dominitz & Robertson опубликовали критический разбор исследования: 1. Выполнена колоноскопия была 42% приглашенных (дошли 11,843 из 28,220 человек). А как известно, лучший скрининг тот, который провели. Низкую явку связали с непопулярностью колоноскопии в Норвегии, Швеции и Польше. Если в Норвегии до врача дошли 60% приглашенных, то в Швеции и Польше всего 40 и 33% соответственно. А вот в финальный расчет включили вообще всех участников. 2. Чтобы оценить преимущества скрининга нужно время. Первоначально при скрининге могут быть выявлены ранние формы опухолей, что повышает уровень риска в когорте, но после полипэктомии риски снижаются, поэтому авторы NordICC планируют повторить анализ через 15 лет. 3. Не всем врачам хватило компетенций. Эффективность колоноскопии зависит от опыта и навыков эндоскописта. Для оценки "эффективности" работы эндоскопистов используется показатель "частота выявления аденомы", который рассчитывается как доля скрининговых колоноскопий, при которых выявляется одна или несколько аденом. Было показано, что каждый 1% связан со снижением заболеваемости в будущем на 3% и на 5% - для показателя смертности . В исследовании NordICC 29% эндоскопистов имели показатель частоты выявления аденомы ниже минимального порога в 25%. 4. Группа риска активнее обследуется. Полученные данные показали, что люди из группы высокого риска, обеспокоенные симптомами или семейным анамнезом, охотнее проходили скрининг, таким образом повышая процент выявленных аденом и опухолей и понижая будущую заболеваемость по сравнению с группой, не проходившей скрининг. Подводя итоги, результаты исследования бросают тень на колоноскопию как эффективный инструмент скрининга. Время подготовки к исследованию, связанные с ним риски и затраты на его проведение подталкивают к выбору более доступных и менее инвазивных методов, таких как сигмоидоскопия или иммуногистохимический анализ кала. Однако окончательный вывод придется подождать 15 лет. Закончить хочется фразой из интересного обзора на эту же тему, вышедшего на днях: “Screening only works, if it gets done.”

Колоноскопия спасает жизни? Точку на знак вопроса в этом предложении заменили результаты NordICC в NEJM. Гипотеза исследования была проста - колоноскопия в качестве скрининга снижает риск развития колоректального рака (КРР). В исследовании участвовало почти 85 тысяч человек из Норвегии, Польши и Швеции. Возрастная группа 55-64 года, для сравнения - NCCN снизило порог прохождения скрининга до 45 лет в группе среднего риска (а это все люди в таком возрасте). Итак, участников разделили на 2 группы: №1 (исходно 28 тыс участников) - приглашали выполнить колоноскопию, №2 (56 тыс) - стандартно наблюдали. В итоге группе №1 выполнило колоноскопию всего 12 тысяч человек. Из них у 62 (0,5%) была обнаружена опухоль, у 3 634 (30,7%) - выявлены и удалены полипы. В течение последующих 10 лет риск развития КРР составил 0.98% (259 случаев) в группе №1 и 1.20% (622 случаев) во группе №2 (ОР 0.82, 95% ДИ, 0.70 - 0.93). Получается, чтобы выявить 1 случай КРР, нужно провести колоноскопию среди 455 (!) пациентов. Еще немного цифр: число развившихся в течение 10 лет случаев рака I-II стадии составило 0.38% и 0.44% в 1 и 2 группах. А число заболеваний III и IV стадий - 0.4% против 0.5%. Сравнение сухих цифр не показало существенной разницы между группами! А если нет разницы, нужна ли колоноскопия? Продолжим обсуждение в следующем посте.

Началась уже вторая рабочая неделя, и мы пытаемся вернуться в рабочий ритм после праздников. Если вам так же трудно, как и нам - то сегодня никакого серьезного контента! Просто видео с нашей самой необычной сотрудницей. Поверьте на слово, одного присутстви ее в офисе достаточно, чтобы держать команду в тонусе! Но, как видите, даже она немного запуталась, а ведь на нее не свалился ворох задач и прошлогодних хвостов! Мы желаем всем хорошего вечера, а завтра вернемся с новыми постами!

Сегодня последний рабочий день в этому году, увидимся в следующем ❄️ Наш график работы во время праздников:

🎄Итоги 2022 года 🎄мы подводить не будем! 🎅 Просто хотим поздравить всех вас с наступающими праздниками 🎅 ⛄️ Мы благодарны каждому за участие, дружбу и за то, что вместе с нами шли к общим целям в уходящем году! И если уж выбирать пожелание, то хочется пожелать всем личного (персонализированного) новогоднего чуда 🎁 🎄 А заодно расскажем, что поменяется в нашей работе в новом году: 🎄В январе начинаем работу в новом офисе на Ленинском проспекте. В канун нового года мы попрощались со старым офисом на Баррикадной 🎄Выводим на рынок тест-систему Соло Атлас и еще несколько совершенно новых продуктов 🎄Переводим всю работу с онкологическими пациентами в партнерские клиники. Теперь всем нашим пациентам доступны еще и экспертные консультации онкологов До встречи в январе 👋

Продолжаем изучать кейс пациентки с EGFR-мутантной аденокарциномой легкого. Как мы писали ранее, кроме EGFR, у пациентки были выявлены две мутации PALB2: наследственная и соматическая. Встатье на Дзене расскажем о том, почему стоит приглядеться к PARP ингибиторам. Разбор всех находок проведен на MTB с участием биологов, enjoy!

В арсенале средств для лечения немелкоклеточного рака легкого пополнение. В этот раз через процедуру ускоренного одобрения прошел KRAS-ингибитор Адаграсиб (Krazati, Mirati Therapeutics, Inc.), теперь его можно назначать взрослым пациентам с мутацией KRAS G12C при местно-распространенном или метастатическом НМРЛ, которые получили одну и более предшествующих линий системной терапии. Чтобы молекулярно-генетические показания для назначения препарата было удобнее определять FDA за компанию одобрило две тест-системы, одну для плазмы - Agilent Resolution ctDx FIRST Assay, вторую для ткани - QIAGEN therascreen KRAS RGQ PCR kit. Если в плазме мутацию не нашли - надо искать ее в образце ткани. Поводом для одобрения стали результаты KRYSTAL-1 (NCT03785249) - многоцентрового, одногруппового, открытого клинического исследования, в которое включали как раз пациентов с местно-распространенным или метастатическим НМРЛ с мутацией KRAS G12C. Эффективность оценивали у 112 пациентов с прогрессированием заболевания во время или после терапии препаратами платины и ингибиторами контрольных точек иммунного ответа, которые назначали вместе или последовательно. Пациенты получали адаграсиб в дозировке 600 мг перорально дважды в день до прогрессирования заболевания или развития непереносимой токсичности. Частота объективного ответа составила 43% (95% ДИ, 34%-53%), а средняя продолжительность ответа - 8,5 месяцев (95% ДИ, 6,2-13,8). Адаграсиб стал вторым одобренным препаратом для терапии пациентов с немелкоклеточным раком легкого при наличии мутации KRAS G12C. Первым, в мае 2021 года, был Соторасиб. Оба препарата - низкомолекулярные ингибиторы ГТФазы RAS, способные специфично и необратимо связываться с мутантным белком KRAS G12C. После связывания ГТФаза остаётся в неактивном состоянии, что потенциально приводит к регрессии опухоли.

Молекулярная биология рака легкого хорошо изучена. Эта нозология лидирует по количеству опций таргетной терапии и выявляемым мишеням. Почти у трети пациентов встречаются активирующие варианты гена EGFR, для которых в первой линии можно использовать EGFR-ингибиторы. А вот в 15% случаев выявляются повреждающие варианты в генах, участвующих в репарации ДНК путем гомологичной рекомбинации (HRR: BRCA1, BRCA2, ATM, PALB2, CHEK2 и тд.), для которых одобренной терапии нет. Разбираемся, что делать с пациентами, у которых встречается комбинация таких биомаркеров. Пациентка с низкодифференцированной аденокарциномой легкого T2N1M1 и выявленным вариантом EGFR p.Leu858Arg. Получала терапию EGFR-ингибиторами (Гефитиниб, Осимертиниб, Афатиниб), лучевую терапию, а также Ниволумаб. После продолжительного ответа на таргеты у пациентки произошло прогрессирование с множественными mts в печень, кости, лимфоузлы и плевру. Затем пациентке выполнили расширенное профилирование. Нашли: 🟢уже известный EGFR p.Leu858Arg 🟢наследственный патогенный (p.Leu531CysfsTer30) и соматический повреждающий (p.Gln420Ter) варианты PALB2, приводящие к биаллельной инактивации PALB2 🟢повреждающий вариант гена ATRX 🟢низкая мутационная нагрузка

💥Разобрали интересный клинический случай пациентки с раком вульвы. Пациентка 61 года, в марте 2020 выявлен рак вульвы (умеренно-дифференцированный плоскоклеточный рак IIIB стадии cT2N2bM0). В конце 2020 - начале 2021 проведены 3 курса ХТ Паклитаксел + Карбоплатин, лучевая терапия (положительный эффект) и фотодинамическая терапия (ФДТ) на остаточную опухоль. В связи с прогрессированием с ноября 2021 по апрель 2022 проведены 7 курсов терапии по схеме Паклитаксел + Карбоплатин + Пембролизумаб (была обнаружена экспрессия PD-L1). В мае проведено расширенное профилирование Solo (биопсия первичной опухоли). На момент получения результатов в июне 2022 пациентка находилась в состоянии прогрессирования первичного опухолевого очага и монотерапии Пембролизумабом. Периодически для облегчения состояния пациентки проводились сеансы хирургического иссечения экзофитного компонента опухоли и сеансов ФДТ. В результаты профилирования нашли: - экспрессия PD-L1 (TPS 2%, CPS 12), - варианты PIK3R1 p.Asp421Asn, KMT2C p.Ala1685Ser, DDR2 p.Arg668His и ERBB2 p.Arg647Lys. Все выявленные генетические варианты не являются клинически значимыми в отношении терапии таргетными препаратами (нейтральные варианты или варианты неопределенной клинической значимости (VUS)).